Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmg20aQ9DC33 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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