Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms