Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms