Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms