Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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