Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Rep15Q9D7T1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Rep15Q9D7T1 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Rep15Q9D7T1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Rep15Q9D7T1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Rep15Q9D7T1 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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