Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms