Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc81Q9D5W4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms