Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rsph14Q9D3W1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rsph14Q9D3W1 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rsph14Q9D3W1 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rsph14Q9D3W1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rsph14Q9D3W1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rsph14Q9D3W1 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rsph14Q9D3W1 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rsph14Q9D3W1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rsph14Q9D3W1 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rsph14Q9D3W1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rsph14Q9D3W1 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rsph14Q9D3W1 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rsph14Q9D3W1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rsph14Q9D3W1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rsph14Q9D3W1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms