Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Zbed3Q9D0L1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Zbed3Q9D0L1 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Zbed3Q9D0L1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Zbed3Q9D0L1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Zbed3Q9D0L1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Zbed3Q9D0L1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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Zbed3Q9D0L1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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Zbed3Q9D0L1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Zbed3Q9D0L1 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Zbed3Q9D0L1 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Zbed3Q9D0L1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Zbed3Q9D0L1 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Zbed3Q9D0L1 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
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Zbed3Q9D0L1 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zbed3Q9D0L1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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