Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rfc5Q9D0F6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rfc5Q9D0F6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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