Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ube2fQ9CY34 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms