Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms