Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rpusd4Q9CWX4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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