Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prkrip1Q9CWV6 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms