Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.2 ms