Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NubplQ9CWD8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms