Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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