Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms