Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rpa3Q9CQ71 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rpa3Q9CQ71 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rpa3Q9CQ71 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rpa3Q9CQ71 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rpa3Q9CQ71 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rpa3Q9CQ71 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rpa3Q9CQ71 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rpa3Q9CQ71 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rpa3Q9CQ71 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpa3Q9CQ71 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms