Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Use1Q9CQ56 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Use1Q9CQ56 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Use1Q9CQ56 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Use1Q9CQ56 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Use1Q9CQ56 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Use1Q9CQ56 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms