Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Chmp3Q9CQ10 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chmp3Q9CQ10 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms