Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
RetnQ99P87 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms