Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Gm20852-202ENSMUST00000188011 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ms4a4dQ99N05 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ms4a4dQ99N05 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms