Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
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PtprtQ99M80 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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PtprtQ99M80 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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PtprtQ99M80 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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PtprtQ99M80 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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PtprtQ99M80 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
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PtprtQ99M80 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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PtprtQ99M80 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprtQ99M80 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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