Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ciao1Q99KN2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ciao1Q99KN2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ciao1Q99KN2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ciao1Q99KN2 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ciao1Q99KN2 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ciao1Q99KN2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ciao1Q99KN2 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ciao1Q99KN2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ciao1Q99KN2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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