Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed9Q99KF1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms