Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TrabdQ99JY4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TrabdQ99JY4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms