Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms