Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CsprsQ99388 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms