Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Knstrn-206ENSMUST00000134661 4602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Uggt1-201ENSMUST00000046875 9033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Tnk2-206ENSMUST00000115125 4313 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Dennd1b-202ENSMUST00000168527 8206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Sdk2-201ENSMUST00000041627 11287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Srgap1-202ENSMUST00000081688 7787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Rsf1-201ENSMUST00000107153 11124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Gm45861-201ENSMUST00000209669 7184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Cdh23-201ENSMUST00000073242 10688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Nlrc5-204ENSMUST00000182409 4552 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Deptor-202ENSMUST00000096433 8547 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Pbrm1-204ENSMUST00000090214 6212 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Ap3s2-201ENSMUST00000075657 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SptssbQ925E8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms