Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp3Q91W36 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp3Q91W36 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp3Q91W36 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp3Q91W36 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp3Q91W36 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp3Q91W36 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp3Q91W36 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp3Q91W36 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp3Q91W36 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp3Q91W36 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp3Q91W36 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp3Q91W36 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp3Q91W36 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp3Q91W36 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp3Q91W36 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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