Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Smg8Q8VE18 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Smg8Q8VE18 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Smg8Q8VE18 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Smg8Q8VE18 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Smg8Q8VE18 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Smg8Q8VE18 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Smg8Q8VE18 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Smg8Q8VE18 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms