Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q8VDP2 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VDP2 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VDP2 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VDP2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VDP2 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VDP2 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q8VDP2 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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