Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L0

Ddx54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx54Q8K4L0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx54Q8K4L0 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms