Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Vrk3Q8K3G5 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Vrk3Q8K3G5 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Vrk3Q8K3G5 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Vrk3Q8K3G5 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Vrk3Q8K3G5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Vrk3Q8K3G5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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Vrk3Q8K3G5 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Vrk3Q8K3G5 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Vrk3Q8K3G5 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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