Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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