Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim68Q8K243 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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