Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cldn34c1Q8K193 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms