Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf628Q8CJ78 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Znf628Q8CJ78 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Znf628Q8CJ78 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Znf628Q8CJ78 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Znf628Q8CJ78 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Znf628Q8CJ78 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Znf628Q8CJ78 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Znf628Q8CJ78 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Znf628Q8CJ78 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms