Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms