Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hpf1Q8CFE2 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hpf1Q8CFE2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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