Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
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Usp27Q8CEG8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Usp27Q8CEG8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Usp27Q8CEG8 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Usp27Q8CEG8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Usp27Q8CEG8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Usp27Q8CEG8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Usp27Q8CEG8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Usp27Q8CEG8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp27Q8CEG8 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Usp27Q8CEG8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Usp27Q8CEG8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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