Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

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Length 866 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc178Q8CDV0 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc178Q8CDV0 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc178Q8CDV0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc178Q8CDV0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc178Q8CDV0 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc178Q8CDV0 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc178Q8CDV0 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc178Q8CDV0 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc178Q8CDV0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc178Q8CDV0 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc178Q8CDV0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc178Q8CDV0 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc178Q8CDV0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc178Q8CDV0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc178Q8CDV0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc178Q8CDV0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc178Q8CDV0 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc178Q8CDV0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc178Q8CDV0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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