Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ufl1Q8CCJ3 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ufl1Q8CCJ3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ufl1Q8CCJ3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms