Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Atg4aQ8C9S8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Atg4aQ8C9S8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Atg4aQ8C9S8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Atg4aQ8C9S8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Atg4aQ8C9S8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Atg4aQ8C9S8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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