Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Usp20Q8C6M1 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Usp20Q8C6M1 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Usp20Q8C6M1 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Usp20Q8C6M1 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Usp20Q8C6M1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Usp20Q8C6M1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Usp20Q8C6M1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Usp20Q8C6M1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Usp20Q8C6M1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Usp20Q8C6M1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Usp20Q8C6M1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp20Q8C6M1 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms