Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Znf428Q8C1M2 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Znf428Q8C1M2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Znf428Q8C1M2 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Znf428Q8C1M2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Znf428Q8C1M2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Znf428Q8C1M2 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Znf428Q8C1M2 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Znf428Q8C1M2 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Znf428Q8C1M2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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