Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ctdsp2Q8BX07 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ctdsp2Q8BX07 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ctdsp2Q8BX07 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ctdsp2Q8BX07 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ctdsp2Q8BX07 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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