Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms